Como ocurre con la mayoría de los controles de plagas, es mejor prevenir que curar las moscas de la fruta, por lo que un alto nivel de higiene es de suma importancia. Sin embargo, si se detectan problemas de plagas, el sitio debe inspeccionarse minuciosamente, ya que pueden tener varios criaderos, donde quiera que haya materiales orgánicos en descomposición, húmedos y en fermentación disponibles.
Hay trampas disponibles para el control de plagas de la mosca de la fruta que utilizan vinagre u otros alimentos fermentados para atraer y capturar moscas de la fruta, como las trampas para jarras. Los pesticidas también son una opción, pero solo pueden brindar un alivio temporal, así que asegúrese de comunicarse con un profesional de control de plagas para discutir las mejores opciones a largo plazo.